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基于鈣黃綠素的閉管LAMP技術(shù)檢測(cè)生肉沙門氏菌

發(fā)布時(shí)間:2025-04-28      瀏覽次數(shù):27    分享:

在食品安全備受關(guān)注的當(dāng)下,肉類中的沙門氏菌污染問題成為公眾焦點(diǎn)。據(jù)統(tǒng)計(jì),全球每年因沙門氏菌感染導(dǎo)致9380萬病例,15.5萬人死亡,在菲律賓,它更是食物中毒爆發(fā)的主要微生物原因。傳統(tǒng)檢測(cè)方法耗時(shí)費(fèi)力,新型分子檢測(cè)技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,其中,一種基于鈣黃綠素的封閉管環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)檢測(cè)方法脫穎而出,為肉類沙門氏菌檢測(cè)帶來新希望。

傳統(tǒng)檢測(cè)困境:耗時(shí)費(fèi)力且昂貴

傳統(tǒng)的細(xì)菌培養(yǎng)檢測(cè)方法一直被視為檢測(cè)沙門氏菌的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但它需要經(jīng)過一系列復(fù)雜的生化和血清學(xué)測(cè)試,整個(gè)過程至少需要6天,耗費(fèi)大量人力、物力和時(shí)間。分子檢測(cè)技術(shù)如常規(guī)PCR雖然能實(shí)現(xiàn)高通量檢測(cè)且耗時(shí)較短,但需要昂貴的設(shè)備、試劑以及專業(yè)技術(shù)人員操作,成本高昂。血清學(xué)檢測(cè)方法雖有快速、經(jīng)濟(jì)等優(yōu)點(diǎn),但易受批次差異、交叉反應(yīng)影響,準(zhǔn)確性欠佳。這些問題在發(fā)展中國(guó)家尤為突出,迫切需要一種更高效、低成本的檢測(cè)方法。

LAMP技術(shù)

LAMP技術(shù)由Notomi等人在2000年開發(fā),為沙門氏菌檢測(cè)開辟了新途徑。它使用4-6種獨(dú)立引物和Bst DNA聚合酶,在60-65℃的恒定溫度下就能進(jìn)行核酸擴(kuò)增,相比常規(guī)PCR,反應(yīng)速度更快,能在短時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生大量產(chǎn)物。而且,LAMP檢測(cè)可以在封閉管內(nèi)完成,減少了開蓋操作帶來的污染風(fēng)險(xiǎn),還能通過比色、熒光或濁度等可視化方式直接判斷結(jié)果,操作簡(jiǎn)單便捷,特別適合小型實(shí)驗(yàn)室和現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)。

LAMP檢測(cè)優(yōu)化:更靈敏、更精準(zhǔn)

研究團(tuán)隊(duì)針對(duì)肉類樣本,對(duì)基于鈣黃綠素的封閉管LAMP檢測(cè)方法進(jìn)行了優(yōu)化。在反應(yīng)體系中,精確調(diào)整了鈣黃綠素、MnCl2和MgSO4的濃度,最終確定為64μM、1mM和5mM,使檢測(cè)結(jié)果在擴(kuò)增后呈現(xiàn)出明顯的顏色差異,陰性為橙色,陽(yáng)性為綠色,便于肉眼觀察。同時(shí),添加甜菜堿有效減少了非特異性擴(kuò)增,提高了檢測(cè)的特異性。優(yōu)化后的LAMP檢測(cè)在65℃反應(yīng)60分鐘,后續(xù)可選擇80℃處理2分鐘使酶失活,整個(gè)流程高效且穩(wěn)定。

性能遠(yuǎn)超常規(guī)PCR

經(jīng)過一系列實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,優(yōu)化后的LAMP檢測(cè)展現(xiàn)出卓越性能。在特異性方面,對(duì)多種沙門氏菌血清型和非沙門氏菌菌株檢測(cè)時(shí),只有沙門氏菌菌株出現(xiàn)擴(kuò)增反應(yīng),證明其引物特異性良好。在靈敏度上,更是優(yōu)于常規(guī)PCR。對(duì)于DNA稀釋系列,LAMP檢測(cè)能檢測(cè)到低至10?5稀釋度的DNA,比常規(guī)PCR靈敏度高10倍;在純細(xì)菌培養(yǎng)檢測(cè)中,LAMP檢測(cè)的最低檢測(cè)限為4.8×103 CFU/mL,相比常規(guī)PCR的4.8×107 CFU/mL,靈敏度提升了1000倍。

 腸炎沙門氏菌(Salmonella enterica)DNA 系列稀釋后的 LAMP 和 PCR 擴(kuò)增結(jié)果

圖1 腸炎沙門氏菌(Salmonella enterica)DNA 系列稀釋后的 LAMP 和 PCR 擴(kuò)增結(jié)果。(A) LAMP 擴(kuò)增產(chǎn)物,陰性管呈橙棕色,陽(yáng)性結(jié)果呈黃綠色。(B - C) 使用 10,000× SYBR® Safe 核酸凝膠染色劑染色后,通過瓊脂糖凝膠電泳觀察 LAMP 和 PCR 產(chǎn)物。試管和泳道 1 - 8:腸炎沙門氏菌腸炎亞種腸炎血清型 ATCC 49223M 的 DNA 從初始濃度 347 ng/μL 開始,依次稀釋至10?8 , 10?7 , 10?6 , 10?5 , 10?4 , 10?3 , 10?2 , 10?1。泳道 L 和 M 分別為 1 kb 和 100 bp 的 DNA 標(biāo)志物。

在對(duì)341份生肉樣本的平行檢測(cè)中,當(dāng)LAMP檢測(cè)與常規(guī)培養(yǎng)富集方法結(jié)合時(shí),對(duì)生雞肉、牛肉和豬肉樣本的檢測(cè)陽(yáng)性率均達(dá)到100%,與常規(guī)PCR檢測(cè)結(jié)果相當(dāng),且顯著高于3小時(shí)縮短富集方案與LAMP檢測(cè)結(jié)合的陽(yáng)性率。這表明優(yōu)化后的LAMP檢測(cè)在結(jié)合常規(guī)培養(yǎng)方法時(shí),能更靈敏、準(zhǔn)確地檢測(cè)出肉類中的沙門氏菌。


對(duì)341份生雞肉、牛肉和豬肉樣本(n=341)進(jìn)行檢測(cè)時(shí),3小時(shí)縮短富集結(jié)合閉管LAMP檢測(cè)(3小時(shí)LAMP)、常規(guī)培養(yǎng)結(jié)合優(yōu)化閉管LAMP檢測(cè)(培養(yǎng)-LAMP)以及常規(guī)培養(yǎng)結(jié)合PCR檢測(cè)(培養(yǎng)-PCR)的陽(yáng)性率

圖2. 對(duì)341份生雞肉、牛肉和豬肉樣本(n=341)進(jìn)行檢測(cè)時(shí),3小時(shí)縮短富集結(jié)合閉管LAMP檢測(cè)(3小時(shí)LAMP)、常規(guī)培養(yǎng)結(jié)合優(yōu)化閉管LAMP檢測(cè)(培養(yǎng)-LAMP)以及常規(guī)培養(yǎng)結(jié)合PCR檢測(cè)(培養(yǎng)-PCR)的陽(yáng)性率。

前景展望

這種優(yōu)化后的LAMP檢測(cè)方法為肉類沙門氏菌檢測(cè)提供了一種強(qiáng)大的補(bǔ)充或替代手段,不僅靈敏度高、特異性強(qiáng),而且操作簡(jiǎn)便、成本較低,適合在資源有限的環(huán)境中推廣應(yīng)用。未來,隨著技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展,有望縮短檢測(cè)前處理時(shí)間,簡(jiǎn)化上游操作步驟,降低檢測(cè)成本,為全球食品安全保障發(fā)揮更大作用。對(duì)于消費(fèi)者來說,這意味著能更快、更準(zhǔn)確地了解肉類食品安全狀況,減少因食用受污染肉類而患病的風(fēng)險(xiǎn),讓餐桌更加安全。

參考文獻(xiàn):Balaga K B, Pavon R D N, Calayag A M B, et al. Development of a closed-tube, calcein-based loop-mediated isothermal amplification assay to detect Salmonella spp. in raw meat samples[J]. Journal of Microbiological Methods, 2024, 220: 106922.

來源:微生物安全與健康網(wǎng),作者~蔡偉程。

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