在食品安全備受關注的當下,肉類中的沙門氏菌污染問題成為公眾焦點。據(jù)統(tǒng)計,全球每年因沙門氏菌感染導致9380萬病例,15.5萬人死亡,在菲律賓,它更是食物中毒爆發(fā)的主要微生物原因。傳統(tǒng)檢測方法耗時費力,新型分子檢測技術應運而生,其中,一種基于鈣黃綠素的封閉管環(huán)介導等溫擴增(LAMP)檢測方法脫穎而出,為肉類沙門氏菌檢測帶來新希望。
傳統(tǒng)檢測困境:耗時費力且昂貴
傳統(tǒng)的細菌培養(yǎng)檢測方法一直被視為檢測沙門氏菌的“金標準”,但它需要經(jīng)過一系列復雜的生化和血清學測試,整個過程至少需要6天,耗費大量人力、物力和時間。分子檢測技術如常規(guī)PCR雖然能實現(xiàn)高通量檢測且耗時較短,但需要昂貴的設備、試劑以及專業(yè)技術人員操作,成本高昂。血清學檢測方法雖有快速、經(jīng)濟等優(yōu)點,但易受批次差異、交叉反應影響,準確性欠佳。這些問題在發(fā)展中國家尤為突出,迫切需要一種更高效、低成本的檢測方法。
LAMP技術
LAMP技術由Notomi等人在2000年開發(fā),為沙門氏菌檢測開辟了新途徑。它使用4-6種獨立引物和Bst DNA聚合酶,在60-65℃的恒定溫度下就能進行核酸擴增,相比常規(guī)PCR,反應速度更快,能在短時間內(nèi)產(chǎn)生大量產(chǎn)物。而且,LAMP檢測可以在封閉管內(nèi)完成,減少了開蓋操作帶來的污染風險,還能通過比色、熒光或濁度等可視化方式直接判斷結果,操作簡單便捷,特別適合小型實驗室和現(xiàn)場檢測。
LAMP檢測優(yōu)化:更靈敏、更精準
研究團隊針對肉類樣本,對基于鈣黃綠素的封閉管LAMP檢測方法進行了優(yōu)化。在反應體系中,精確調(diào)整了鈣黃綠素、MnCl2和MgSO4的濃度,最終確定為64μM、1mM和5mM,使檢測結果在擴增后呈現(xiàn)出明顯的顏色差異,陰性為橙色,陽性為綠色,便于肉眼觀察。同時,添加甜菜堿有效減少了非特異性擴增,提高了檢測的特異性。優(yōu)化后的LAMP檢測在65℃反應60分鐘,后續(xù)可選擇80℃處理2分鐘使酶失活,整個流程高效且穩(wěn)定。
性能遠超常規(guī)PCR
經(jīng)過一系列實驗驗證,優(yōu)化后的LAMP檢測展現(xiàn)出卓越性能。在特異性方面,對多種沙門氏菌血清型和非沙門氏菌菌株檢測時,只有沙門氏菌菌株出現(xiàn)擴增反應,證明其引物特異性良好。在靈敏度上,更是優(yōu)于常規(guī)PCR。對于DNA稀釋系列,LAMP檢測能檢測到低至10?5稀釋度的DNA,比常規(guī)PCR靈敏度高10倍;在純細菌培養(yǎng)檢測中,LAMP檢測的最低檢測限為4.8×103 CFU/mL,相比常規(guī)PCR的4.8×107 CFU/mL,靈敏度提升了1000倍。
圖1 腸炎沙門氏菌(Salmonella enterica)DNA 系列稀釋后的 LAMP 和 PCR 擴增結果。(A) LAMP 擴增產(chǎn)物,陰性管呈橙棕色,陽性結果呈黃綠色。(B - C) 使用 10,000× SYBR® Safe 核酸凝膠染色劑染色后,通過瓊脂糖凝膠電泳觀察 LAMP 和 PCR 產(chǎn)物。試管和泳道 1 - 8:腸炎沙門氏菌腸炎亞種腸炎血清型 ATCC 49223M 的 DNA 從初始濃度 347 ng/μL 開始,依次稀釋至10?8 , 10?7 , 10?6 , 10?5 , 10?4 , 10?3 , 10?2 , 10?1。泳道 L 和 M 分別為 1 kb 和 100 bp 的 DNA 標志物。
在對341份生肉樣本的平行檢測中,當LAMP檢測與常規(guī)培養(yǎng)富集方法結合時,對生雞肉、牛肉和豬肉樣本的檢測陽性率均達到100%,與常規(guī)PCR檢測結果相當,且顯著高于3小時縮短富集方案與LAMP檢測結合的陽性率。這表明優(yōu)化后的LAMP檢測在結合常規(guī)培養(yǎng)方法時,能更靈敏、準確地檢測出肉類中的沙門氏菌。
圖2. 對341份生雞肉、牛肉和豬肉樣本(n=341)進行檢測時,3小時縮短富集結合閉管LAMP檢測(3小時LAMP)、常規(guī)培養(yǎng)結合優(yōu)化閉管LAMP檢測(培養(yǎng)-LAMP)以及常規(guī)培養(yǎng)結合PCR檢測(培養(yǎng)-PCR)的陽性率。
前景展望
這種優(yōu)化后的LAMP檢測方法為肉類沙門氏菌檢測提供了一種強大的補充或替代手段,不僅靈敏度高、特異性強,而且操作簡便、成本較低,適合在資源有限的環(huán)境中推廣應用。未來,隨著技術的進一步發(fā)展,有望縮短檢測前處理時間,簡化上游操作步驟,降低檢測成本,為全球食品安全保障發(fā)揮更大作用。對于消費者來說,這意味著能更快、更準確地了解肉類食品安全狀況,減少因食用受污染肉類而患病的風險,讓餐桌更加安全。
參考文獻:Balaga K B, Pavon R D N, Calayag A M B, et al. Development of a closed-tube, calcein-based loop-mediated isothermal amplification assay to detect Salmonella spp. in raw meat samples[J]. Journal of Microbiological Methods, 2024, 220: 106922.
來源:微生物安全與健康網(wǎng),作者~蔡偉程。