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NGS Fast Ligation Module(NGS 快速連接模塊)

英文名稱:NGS Fast Ligation Module

貨 號(hào) :HKM066A

規(guī) 格 :24次/盒

用途:將 DNA adapter 與 3'端添加 dA 的 DNA 文庫(kù)片段的快速連接…

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產(chǎn)品名稱:NGS Fast Ligation Module
中文名稱:NGS 快速連接模塊

產(chǎn)品編號(hào)與包裝規(guī)格:

編號(hào)產(chǎn)品名稱規(guī)格產(chǎn)品介紹價(jià)格
HKM066ANGS Fast Ligation Module24次/盒預(yù)混酶模塊(NGS 快速連接)2745

產(chǎn)品描述:

      NGS Fast Ligation module 是專門針對(duì)于 illumina 高通量測(cè)序平臺(tái)所優(yōu)化的預(yù)混酶模塊。使用本模塊可以將 3'端 帶有 dA 尾的 DNA 片段與 adapter 進(jìn)行快速連接。與常規(guī)方法比較,本模塊采用了一步法反應(yīng)流程,NGS DNA Fragmentation/End Repair/dA-Tailing Module 或 NGS DNA End Repair/dA-Tailing Module 反應(yīng)后所獲得的片段后 DNA,無(wú)需磁珠純化,可使用本模塊直接與 adapter 進(jìn)行連接,省去了多步磁珠純化步驟,操作更加簡(jiǎn)便,文庫(kù)轉(zhuǎn) 化效率更高。
      適用范圍:將 DNA adapter 與 3'端添加 dA 的 DNA 文庫(kù)片段的快速連接(如 NGS DNA Fragmentation Module 和 EndRepair/dA-tailing Module 處理后的產(chǎn)物)。
      適用樣本量:1ng -1μg DNA。

產(chǎn)品特點(diǎn):
      1) 無(wú)需磁珠純化,可直接將 DNA adapter 與帶有 dA-Tailing 的 DNA 片段連接;
      2) 連接效率高,可進(jìn)行微量樣本的 DNA adapter 連接。

注意事項(xiàng):
      1、開(kāi)始實(shí)驗(yàn)前,對(duì) DNA 濃度精確定量至關(guān)重要,推薦 DNA 上樣量為 1ng-1μg。DNA可溶解于去離子水、10 mM Tris Buffer EB 或 0.1×TE 等。
      2、推薦 DNA 的上樣量指的是片段化后的 dsDNA 的量。推薦 使用 Qubit、Picogreen 或者其他染料法對(duì) DNA 濃度進(jìn)行精確定 量。
      3、請(qǐng)確認(rèn) DNA 溶液中不含陽(yáng)離子及螯合劑,如果 DNA 溶解 于 1×TE 或不確定 DNA 溶液中的 EDTA 濃度,需先對(duì) DNA 進(jìn)行純化后再進(jìn)行片段化反應(yīng)。

保存條件:-20℃保存,盡量避免反復(fù)凍融。

NGS Fast Ligation Module 產(chǎn)品組成:

 A 包裝(24 次)B 包裝(96 次)
Adapter-ligation Enzyme120μl480μl
Adapter-ligation Buffer1ml×21ml×5
RNase Free Water1ml1ml×2

操作步驟:

1,根據(jù)經(jīng) NGS DNA Fragmentation Module 和 End Repair/dA-Tailing Module 處理后的產(chǎn)物的量,計(jì)算使用接頭 的量并按照下表對(duì)接頭濃度進(jìn)行稀釋:

起始樣本量 Adapter稀釋倍數(shù)稀釋后 Adapter
100ng<X≤1μg不稀釋10μM
25ng<X≤100ng稀釋 2 倍5μM
5ng<X≤25ng稀釋 10 倍1μM
1ng<X≤5ng稀釋 25 倍0.4μM

2,按照下表所示各組分用量配制反應(yīng)體系,并將配制完成的反應(yīng)體系輕柔混勻后置于冰上

名稱體積
dA-tailed DNA40μl
Adapter -Ligation Buffer50μl*
Adapter -Ligation Enzyme5μl
DNA Adapter5μl**
Total volume100μl

注:* Adapter -Ligation Buffer 長(zhǎng)時(shí)間放置會(huì)有白色沉淀,用前請(qǐng)上下顛倒、振蕩,使液體中白色沉淀充分溶 解并瞬時(shí)離心后使用。 
      **本公司接頭濃度為 10μM,請(qǐng)根據(jù)片段化 dsDNA 量對(duì)接頭進(jìn)行稀釋,加水補(bǔ)齊,使接頭體積為 5μl。

3,將此配制好的 100μl連接反應(yīng)液輕柔吸打混勻,置于 PCR 儀中,反應(yīng)程序如下:

溫度時(shí)間
熱蓋 105℃off
16℃15min
4℃Hold

注:當(dāng)片段化 dsDNA 量較低,實(shí)驗(yàn)效果不理想時(shí),可嘗試將連接時(shí)間延長(zhǎng)一倍。

4,連接產(chǎn)物磁珠純化(Post Ligation Clean Up) 該步驟使用磁珠對(duì)連接產(chǎn)物進(jìn)行純化或分選。純化可除去未連 接的 Adapter 或 Adapter Dimer 等無(wú)效產(chǎn)物。

連接產(chǎn)物磁珠純化(Post Ligation Clean Up)

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